本篇文章给大家谈谈生信linux学习，以及生信为什么用Linux对应的知识点，希望对各位有所帮助，不要忘了收藏本站喔。
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【Linux】生物信息软件安装过程
你可以去***上下载软件 ***：// 该软件是无需安装的，下载完毕即可使用，适用于Linux， MacOS and windows操作系统。下载完毕，解压，然后把你要构树的序列比对成。
Hat公司开发的软件安装包，rpm可让Linux在安装软件包时免除许多复杂的手续。该命令在安装时常用的参数是 –ivh ，其中i表示将安装指定的rmp软件包，V表示安装时的详细信息，h表示在安装期间出现“#”符号来显示目前的安装过程。
创建安装映像：使用Linux安装媒体上的工具，例如Rufus或Nautilus，创建一个Linux安装映像。这个映像将包含所有必需的文件和目录结构，以及您的用户和群组文件。
生物信息学安装哪个版本的linux
1、选择Windows还是linux？ 一定是linux，windows太多的生物软件不兼容了。选择linux的哪个版本？推荐桌面版的Ubuntu——稳定，美观，适合初学者之称；次之，Centos——免费、稳定的服务器linux版本之称。
2、一门脚本语言，个人推荐python（Perl也可以，各有利弊，Python更新兴一些）。Linux系统。这个也不是百分百要求，但是专业的生信人，都是用Linux的，而且很多软件都是不支持Windows的。
3、对于操作系统，在工作站方面，推荐Mac OS。它运行稳定，与LINUX同源。需要下载安装Xcode和wget就可以了。当然你还可以很方便的安装office办公软件，以及photoshop，AI等工具。最后安装好R/Bioconductor，就可以开始工作了。
生物背景入门生物信息学,需要补哪些计算机知识?
1、学会Linux的基础操作，譬如常见的ls，grep，less，ark等即可。当然最开始接触Linux的时候会各种不习惯，比较好的学习手段是把自己的笔记本装成Linux，大多数人喜欢mate界面的fedora。
2、其次，你需要学习计算机科学和信息技术的基础知识，包括编程语言（如Python、R等）、数据结构和算法、数据库管理等。这些技能将帮助你处理和分析生物数据。
3、基础知识包括linux基本操作，python或perl随便一门编程语言，R语言常用，要学。熟悉各大生物数据库（主要查询和下载数据），熟悉生信常用到的格式，常用软件的使用。
生信小白学习系列:如何进行基因组组装?(1)
重叠序列相连 [_a***_]来说这种算法就是将所有的reads拿出来，相互比对，找到重叠的reads，然后构建长的连续的contigs，最后再将contigs组在一起形成scaffolds。
要进化。由于叶绿体需要高度进化，但是它的序列比较困难，这就使得叶绿体基因组进行组装变得更加重要。
有两种组装方式：1，de-novo构建； 2，有参考基因组重构。其中de-novo组装是指在不依赖参考基因组的情况下，将有overlap的reads连接成一个更长的序列，经过不断的延伸，拼成一个个的contig及scaffold。
这时，只要把biopython从78降到77就可以了 命令：conda install -y -c conda-forge biopython=77 就可以覆盖安装了，而且神奇的是安装完就可以使用了，输入 busco -h 不会报错。
DNA测序数据分析软件：包括FastQC、Trimmomatic、BWA等。这些软件用于处理、清洗和比对DNA测序数据，提取有用的信息。 基因组组装软件：如SPAdes、Velvet等。这些软件用于将短片段的DNA序列重新组装成较长的连续序列。
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